lammps教程:in文件结构详解以及一个比较实用的in文件模板

壹►lammps软件的in文件是所有命令输入的核心，掌握编写in文件对于初学者而言是一项关键技能。in文件实质上是一个文本文档，无需特定后缀名，任何名称的文件均能运行。在in文件中，命令按照编写顺序执行，大多数情况下，命令执行顺序影响不大，但涉及依赖参数的命令则需确保参数定义和计算在执行前完成。

贰‌►案例集一：基础入门与in文件结构 内容：介绍LAMMPS的基本概念、安装方法、in文件的结构格式以及基本语法。通过实例操作，用户将学会如何编写和运行简单的LAMMPS模拟脚本。重点：理解LAMMPS的in文件结构，掌握常用命令的语法和用法。

叁‌►准备in文件：创建一个名为“ice_adhesion.in”的文本文件。在文件中编写模拟所需的LAMMPS命令，这些命令将生成模拟盒子、创建原子、施加加速度并输出速度分布信息。模拟设置：使用create_box命令生成模拟盒子。使用create_atoms命令在盒子中生成原子。设置模拟参数，如温度、时间步长等。

肆►通过atomsk --create fcc65 Fe Fe.xsf生成面心立方结构。多晶节点文件（如polycrystal.txt）：定义盒子尺寸、晶粒数量及分布方式。例如，box 200 200 200 random 20表示生成200×200×200 盒子内随机分布的20个晶粒。

伍‌►in文件：同时提供了对应的in文件，in文件是LAMMPS模拟的输入脚本，用于定义模拟的参数、条件以及执行流程等。力场文件：不需要额外的力场文件，说明该案例可能使用了LAMMPS内置的力场或者已在data文件或in文件中隐式定义了力场参数。

陆►也可以在data文件中删除键角等信息。处理后的data文件为：在Ovito中打开ZnO文件，可以正常显示，在lammps in文件中也可以正常读取这个模型。使用msi2lmp工具转换data文件的主要目的是获得原子的拓扑结构，因此，即使在MS中力场参数设置不全，也可以转换data文件，稍作处理后即可使用。